Diferenciálně exprimované geny v odnožovacích uzlech a listech ozimého ječmene během chladové aklimatizace
Abstrakt
Rostliny mírného pásma se adaptovaly na sezónní změny teploty přizpůsobením metabolismu na podzim zvyšováním obsahu kryoprotektivních látek. Porovnávali jsme transkripční profily odnožovacích uzlů a listů ozimého ječmene v průběhu chladové aklimatizace.
S využitím DNA čipů Affymetrix a softwaru GeneSpring jsme identifikovali 6197 diferenciálně exprimovaných genů v listech a 2370 v odnožovacích uzlech. Navíc byly rozlišeny dvě skupiny genů exprimovaných pouze v listech nebo odnožovacích uzlech.
Byly provedeny tři klastrovací analýzy na souboru genů, jejichž exprese se měnila v obou orgánech, specificky v listech a specificky v odnožovacích uzlech. Každý klastr byl charakterizován typickým průběhem a funkčními kategoriemi determinovanými podle databáze MIPS.
U obou orgánů byly udělány testy mrazové odolnosti.