Trichomonas vaginalis je jedním z mála eukaryot, u nichž bylo nalezeno několik homologů flavodiiron proteinů (FDPs). Proteiny široce rozšířené u anaerobních prokaryot jsou považovány za reduktasu kyslíku popř. oxidu dusnatého, čímž chrání nositele před oxidativním/nitrosativním stresem a imunitní odpovědí hostitele.