Experimentální zvířecí modely zánětlivých střevních chorob umožňují studovat možná etiologická agens,ovlivňovat interakce mezi jednoltivými komponentami podílejícími se na jejich patogenezi,identifikovat imunologické procesy a predisponující geny metodami,které nelze použít u lidí. Podán přehled IBD vyvolaných chemicky, dále spontánně, modely založené na genetické manipulaci a modely imunologické.