Určení strategie profylaxe pozdní hematogenní infekce není jednoduché. Vyžaduje posouzení rizikových faktorů nemocného a možného zdroje potenciální bakteriémie.
Musí se také posoudit finanční efektivita, účinnost zvoleného antibiotika a komplikace spojené s rutinním podáváním antibiotika, jako jsou alergie a rozvoj rezistence na dané antibiotikum