PCR (polymerase chain reaction) diagnostika je určena hlavně pro lékaře na infekčních odděleních, dětských odděleních, JIP a lůžkových ARO. V Národní referenční laboratoři pro meningokokové nákazy je zavedena metoda PCR pro detekci Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae a Streptococcus pneumoniae, která rozšiřuje bezkultivační metody (přímou mikroskopii a latexovou aglutinaci) dosud užívané v diagnostice závažných bakteriálních onemocnění.
Tato metoda umožňuje rychlé určení patogena o nízké koncentraci přímo z klinického materiálu.