Přes výrazné zlepšení výsledků léčby karcinomu prsu během posledních 25 let, zvláště u podskupiny nádorů hormonálně závislých a exprimujících protein HER2, zůstává toto onemocnění nejčastější příčinou úmrtí u žen ve vyspělých státech světa. S vývojem molekulární biologie a genetiky se dříve patologicky homogenní nosologické jednotky rozpadají na podskupiny nádorů, které se liší nejen svými charakteristikami, ale především biologickým chováním a odpovědí na léčbu.
Genové expresní profilování umožnilo klasifikaci karcinomu prsu na čtyři podskupiny, tzv. "intrinsic subtypes" (luminální A, luminální B, HER2-obohacený a "basal-like" a normální "breast-like"). Jednotlivé podskupiny se liší výskytem, přežíváním a odpovědí na léčbu.
Zároveň komplementují informace klasických klinicko-patologických markerů. S postupujícím vývojem genetických studií lze očekávat identifikace dalších specifických podtypů.
Nedávno byl identifikován další podtyp u myších nádorů a u buněčných linií karcinomu prsu, "Claudin-low", charakterizovaný jako triple-negativní invazivní duktální karcinom s vysokou frekvencí metaplastické a medulární diferenciace. Tato nová subklasifikace společně s klasickými klinicko-patologickými markery by měla přispět ke zlepšení úspěšnosti léčby v době širokého rozvoje nových molekul cílené terapie.
Přibližně 75 % všech nádorů prsu exprimuje hormonální receptory, estrogenní či progesteronové. Hormonální léčba - ať již při použití selektivních modulátorů estrogenních receptorů (tamoxifen), či inhibitorů aromatázy - je účinná asi u 2/3 nemocných.
Avšak až 1/3 karcinomů prsu jsou nádory primárně rezistentní na hormonální terapii a většina pacientek, které původně odpověděly na hormonální terapii, se stane rezistentními na tuto léčbu.