Žofínský prales představuje unikátní ukázku krajiny, která v podhorských a horských polohách zřejmě převažovala před příchodem člověka. Kvůli obrovské rozmanitosti epifytických lišejníků se řadí k nejvýznamnějším lichenologickým lokalitám v ČR.
Množství taxonů zde bylo zaznamenáno vůbec poprvé na našem území.