Nutnou podmínkou léčby metabolické osteopatie a kloubních obtíží u celiakálního jedince je celoživotní úplná bezlepková dieta s dostatečným dietním příjmem vitaminu D a vápníku. Deficit vitaminu D a sekundární hyperparatyreoidismus vyžadují medikamentózní suplementaci vitaminem D společně s vápníkem.
Ve vybraných případech je indikována u celiakálního pacienta i farmakologická léčba osteoporózy. Jedinec s celiakii má být celoživotně dispenzarizován gastroenterologem, který v případě diagnózy metabolické osteopatie spolupracuje v léčbě s osteologem.
Bezlepková dieta do velké míry zlepšuje metabolickou osteopatii, kloubní obtíže i myopatii provázející celiakii; v konečném efektu tak rovněž přispívá k redukci rizika osteoporotických i neosteoporotických zlomenin. Úlohou ortopeda či traumatologa je vyjádřit podezření na celiakii u pacientů nestandardně reagujících na léčbu bolestivých syndromů pohybového aparátu, pacientů s opakovanými zlomeninami skeletu končetin a dále u pacientů mladšího věku se suspekcí na sekundární osteoporózu. Screeningová vyšetření celia-kálních autoprotilátek přispějí ke stanovení diagnózy.
Adekvátní léčbou pak lze dosáhnout zlepšení kostního a kloubního stavu nemocného.