Abstrakt
Enzymy polymerázy, podílející se na replikaci, transkripci a reparaci nukleových kyselin, jsou z evolučního hlediska silně konzervované a jakákoliv DNA varianta v délce jejich kódující oblasti je pod silným selekčním tlakem. V nedávné době byly germinální varianty nacházející se v oblasti excizní domény genů polymerázy delta (PolD1) a polymerázy epsilon (PolE) spojeny s dominantně dědičným syndromem PAPP (Polymerase proofreading-associated polyposis).
Polymeráza Beta (PolB je důležitým článkem DNA oprav typu BER (base-excision repair). Není sice spojována s dědičným onemocněním typu PAPP, ale v nádorech tlustého střeva se vyskytuje mnoho somatických mutací (až 30% nádorů), které vykazují klonalitu a mohli by být zodpovědné za nádorový rozklad genové integrity.
Na našem pracovišti byl vytvořen NGS panel cílící do oblastí vybraných polymeráz s cílem zachytit převážně somatické mutace v nádorové tkáni skupiny pacientů s kolorektálním karcinomem sporadického výskytu. Smyslem tohoto projektu bylo zavedení metody na detekci somatických mutací s maximálním využitím souboru DNA, která již je na pracovišti k dispozici.
Získaná data byla vyhodnocena a rozšířen přehled charakteristik pacientů a samotných nádorů. Jedním z důležitých cílů této práce bylo získání zkušeností se zpracováním objemných NGS dat a příprava pilotní studie pro budoucí projekty.