Z Havlíčkova publicistického díla i korespondence je zřejmé, že Jan Hus byl pro něj výzvou po celou dobu jeho dospělosti. Přemýšlel o něm jako o morální autoritě pro své současníky, jako o příkladném vzoru pro zahraničí.
Považoval jej za kritika církevních nešvarů a církevní hierarchie, jehož názory tak podle něj souzněly s názory Havlíčkových souputníků.