Jedním z možných cílů akcionářských dohod je dosáhnout dohody ohledně obsazení jednotlivých funkcí ve správní radě (má-li společnost monistickou strukturu) nebo ve statutárním orgánu a dozorčí radě (má-li společnost strukturu dualistickou). Vliv společníků na složení těchto orgánů může mít ryze korporátní základ, např. při využití násobných hlasovacích práv nebo podílů s vysílacími právy.
Stejně tak může jít o vliv čistě obligačního charakteru, kdy akcionářské dohody vytváří vnitřní (šedou) strukturu, která sice není reflektov ána "oficiální" organizační strukturou akciové společnosti, přesto však může mít rozhodující dopad na rozhodovací procesy. Těmito a některými dalšími otázkami se článek zabývá.