Peroperační biopsie je nedílnou součástí diagnostických protokolů v onkogynekologii a může být indikována za účelem
1) stanovení biologické povahy patologického procesu (odlišení nenádorových lézí a nádorů),
2) určení histologického typu nádoru a odhadu biologického chování (typing),
3) potvrzení či vyloučení metastatického původu nádoru,
4) stanovení stupně diferenciace a lokálního rozsahu maligního nádoru (grading a staging),
5) detekce nádorových depozit v lymfatických uzlinách,
6) vyšetření chirurgických resekčních okrajů,
7) detekce těhotenských reziduí v kyretáži děložní dutiny při podezření na extrauterinní graviditu a
8) odběru nativní nádorové tkáně pro specializovaná vyšetření (molekulární metody, průtoková cytometrie). Nejčastěji je vyžadováno peroperační vyšetření adnexálních expanzivních procesů s důrazem na identifikaci a klasifikaci maligních nádorů, rozlišení borderline nádorů a karcinomů a rozpoznání metastatického postižení ovaria. Mezi další typické aplikace peroperačního vyšetření spadá stratifikace pacientek s karcinomem korporálního endometria do rizikových skupin pro indikaci lymfadenektomie, hodnocení stavu endocervikálního chirurgického okraje při fertilitu šetřících a méně radikálních operacích pro karcinom děložního hrdla a detekce nádorového postižení lymfatických uzlin (včetně sentinelových lymfatických uzlin). Pro správnou interpretaci peroperačního vyšetření je nezbytná znalost relevantních klinických a anamnestických údajů pacientky, posouzení histologického nálezu v kontextu makroskopického vzhledu zaslaného materiálu a v neposlední řadě aktivní komunikace s klinikem.