Střevní milkrobiom hraje důležitou roli v imunitní odpovědi proti nádorům a jeho složení koreluje s terapeutickým účinkem inhibitorů kontrolních bodů imunity. Navíc střevní mikrobiom ovlivňuje riziko závažné gastrointestinální toxicity během této léčby.
Léčba antibiotiky během imunoterapie je spojena se špatnou odpovědí na inhibitory kontrolních bodů. Interakce mezi střevním mikrobiomem a protinádorovou imunitou může zahrnovat aktivaci vrozené imunity bakteriálními antigeny a produkty, ale také generování imunosupresivního nebo imunostimulačního mikroprostředí bakteriálními metabolity.
Fekální biomarkery kolorektálního karcinomu zahrnuj í laktát, sukcinát a aminokyseliny obecně, podobně jako metabolity polyaminů, zatímco hladiny glukózy, glutaminu a mastných kyselin s krátkým řetězcem jsou sníženy. u všech těchto metabolitů se prokázala interakce s imunitním systémem.