Územní ochrana přírody je důležitým nástrojem pro ochranu biodiverzity a přirozených procesů. V praxi však často naráží na další zájmy spojené s lidskou činností, které vedou k rozrůstání antropogenně ovlivněných ploch, úbytku vhodných stanovišť a fragmentaci krajiny.
To se týká i naší člověkem ovlivněné středoevropské krajiny. Mezi jedny z nejzachovalejších koutů v tomto kontextu patří Šumava se svým národním parkem.