IPP v léčbě a prevenci vředové a refluxní choroby IPP snižují sekreci kyseliny solné v koncovém článku, tedy na všechny podněty (stimulaci gastrinem, histaminem i cholinergní stimulací). Jedná se o nejúčinnější léčbu, jsou schopny udržet pH v žaludku nad 4 po dobu téměř 24 hod, jak postprandiálně, tak noční sekreci.
Na rozdíl od H2 R-I se neobjevuje tachyfylaxe, není nutná eskalace dávky. Rovněž v potlačení bazální sekrece kyseliny solné mimo stimulaci jsou IPP účinnější než H2 R-I.
Tyto vlastnosti vedou k preferenci této skupiny v léčbě a v profylaxi řady afekcí horní č ásti trávicího traktu či v prevenci krvácení do trávicího traktu. V ČR je poměr spotřeby IPP ku H2 R-I asi 30 : 1, jinde je výrazně menší