Tento článek se snaží ukázat, že i když je faktorová analýza (většinou ve své explorační verzi) metodou, kterou často používají výzkumníci v sociálních vědách (často se o ní hovoří i v základních učebnicích analýzy dat), používá se pouze její velmi základní verze, jejíž nastavení zdaleka není optimální. To, jaké nastavení se použije, však může mít zásadní důsledky, především v podobě konceptuálních problémů, kde se často používá explorativní verze namísto konfirmační.
Vliv na výsledky mohou mít i další použitá nastavení.