Laboratorní diagnostika Shiga toxin-produkujících E. coli v Národní referenční laboratoři pro E. coli a shigely a metodická doporučení pro klinické laboratoře

Abstrakt

V tomto článku podáváme metodickou informaci o laboratorní diagnostice infekcí vyvolaných Shiga toxin-produkujícími kmeny E. coli s důrazem na molekulární metody. Dále informujeme o zavedení celogenomového sekvenování těchto kmenů v Národní referenční laboratoři pro E. coli a shigely pro účely rozpoznání národních i mezinárodních epidemií.

Klíčová slova

• Národní referenční laboratoř pro E. coli a shigely
• E. coli, patotyp
• faktory virulence
• Shiga toxiny
• Shiga toxin-produkující E. coli
• hemolyticko-uremický syndrom
• séroskupina
• patogenita
• celogenomové sekvenovaní
• klastr
• metodická doporučení