Cílem této kapitoly je ukázat, že dobře navržená a teoreticky podložená korpusová anotace významně přispívá k využití korpusu pro testování lingvistické teorie a pro její další rozvoj. Data našich analýz pocházejí z korpusové rodiny Prague Dependency Treebank; jde o jednojazyčná česká data a o paralelní anglicko-česká data, která se týkají základní syntaktické úrovně popisu jazyka a anotace struktury diskurzu.
Konkrétní případové studie se týkají tří výzkumných otázek, a to (i) sémantické relevance informační struktury věty, (ii) vztahu mezi fokalizátory a diskurzními konektory vzhledem k sémantice diskurzních vztahů a (iii) vztahu mezi primárními a sekundárními spojovacími výrazy. V příloze jsou uvedeny a rozebrány údaje o měření mezianotátorské shody.