Profylaxe flebotrombózy u onkologických pacientů je významným tématem s ohledem na rizika morbidity a mortality. Poměrně jasné stanovisko k profylaxi je uváděno u pacientů hospitalizovaných s malignitou a s omezenou mobilitou, u kterých je doporučena tromboprofylaxe s LMWH či fondaparinuxem (je-li clearance kreatininu >= 30 ml/min), případně heparinem.
V aktuálním vydání Modré knihy České onkologické společnsoti je toto základní doporučení mírně rozšířeno - u hospitalizovaných pacientů s aktivní malignitou a akutním interním onemocněním nebo omezenou hybností je doporučena farmakologická tromboprofylaxe, pokud nekrvácí nebo nemají jiné kontraindikace.