Život na Zemi pravděpodobně vznikl a je určován různými typy mikroorganismů. Mikroorganismy představují faktor, který výrazně ovlivňuje evoluci člověka.
Evoluční interakce jsou tak významné, že část genetické informace člověka má původ v mikrobiálním světě. Energetické potřeby lidských buněk zajišťují mitochondrie, které jsou archebakteriálními endosymbionty.
Současné lidstvo je výsledkem permanentního selekčního tlaku, který byl ve významné míře zprostředkován patogenními mikroorganismy. I současná medicína se v převažující míře soustředí na působení patogenních mikroorganismů.
Teprve v posledním desetiletí díky metodologickému pokroku získáváme obrovské množství informací, které dokládá, že naše t ělo je osídleno mikrobiálními společenstvími, mikrobiotou, která má zásadní vliv na zdraví člověka. Moderní člověk navíc ztrácí přirozené kontakty s mikrobiálním světem, který je negativně zásadně měněn v souvislosti se zhoršujícím se životním prostředím.