Játra jsou centrálním orgánem metabolismu, který hraje klíčovou roli v metabolismu lipidů. Absorbované volné mastné kyseliny a mastné kyseliny pocházející z tukové tkáně se dostávají do jater, zde utilizovány jako energetický zdroj, jsou resyntetizovány na triglyceridy, nebo jsou stavební součástí komplexních lipidů. Játra mají ústřední roli v homeostáze cholesterolu, který oxidují žlučové kyseliny nebo vylučují přímo do žluče.
Metabolické choroby (jako je obezita, diabetes mellitus 2. typu a některé dyslipidérnie) vedou k rozvoji chronické hepatopatie, jak je tomu u nealkoholové steatózy (NAFLD); na druhé straně některé chronické hepatopatie (jaterní cirhóza, chronická cholestáza) zapříčiňují vznik dyslipidémie charakterizované přítomností lipoproteinu X. Tato práce ve stručnosti shrnuje vztah mezi metabolismem lipidů/lipoproteinů a chronickými onemocněními jater se zaměřením na NAFLD, cholestázu, alkoholovou jaterní chorobu, virové hepatitidy a cirhózu.