Navzdory pokrokům v prevenci a novým způsobům léčby zůstávají metabolická onemocnění, v čele s aterosklerotickým kardiovaskulárním onemocněním, hlavní příčinou morbidity a mortality ve vyspělých zemích. Pokroky v poznání a objevování nových souvislostí v etiologii metabolických onemocnění otevřely také prostor pro výzkum střevního mikrobiomu a jeho zapojení do patogeneze onemocnění.
Střevní mikrobiom se skládá z bilionů metabolicky aktivních organismů, které produkují mnoho působků, mimo jiné trimetylamin N-oxid, sekundární žlučové kyseliny, lipopolysacharidy, mastné kyseliny s krátkým řetězcem a další, které vstupují do patogeneze metabolických onemocnění. Také samotná bakteriální DNA byla nalezena přímo v aterosklerotických plátech.