Publikace na Matematicko-fyzikální fakulta |
2009
Abstrakt
Zkoumáme slévání dvou bublin v DNA původně lokalizovaných na slabých segmentech a oddělených stabilnější bariérovou oblastí v navrženém konstruktu dvouvláknové DNA.Ve spojitém Fokker-Planckově přístupu odvodíme charakteristický čas slévání a jeho rozdělení stejně jako rozdělení pozice slévání podél bariéry. Pod teplotou tání nalézáme chování Kramersova typu pro překonání bariéry, zatímco pro vysoké teploty špičky bublin provádějí difuzi s driftem směrem ke splynutí.
Ve výpočtech mapujeme dynamiku bublin na problém dvou 'vicious walkers' v opačných potenciálech. Prezentujeme rovněž diskrétní přístup k problému pomocí říd ící rovnice.