Intraoperační enteroskopie je invazivní metoda vyšetření tenkého střeva. Výkon probíhá v celkové anestezii na chirurgickém sále (tedy ve spolupráci s chirurgem a anesteziologem), endoskopista je součástí operačního týmu.
Vyšetření se provádí sterilním přístrojem a akcesorii. Výhodou je vyšetření celého tenkého střeva s možností okamžitého řešení zjištěného patologického nálezu endoskopistou či chirurgem.
Vzhledem k invazivnímu charakteru intraoperační enteroskopie je důležitá správná indikace vyšetření.