Identifikace proteinů pomocí kombinace proteinové hmotností spektrometrie a fragmentace sulfonovaných proteinů
2007
Abstrakt
MALDI-TOF MS je ideální metodou pro rutinní identifikaci bílkovin separovaných dvojrozměrnou elektroforézou na polyakrylamidovém gelu (2D-PAGE). Nicméně v některých případech výsledky z fingerprintingu peptidové hmoty (PMF) neumožní jednoznačnou identifikaci bílkovin.
V takových situacích by bylo určení částečné aminokyselinové sekvence cílové bílkoviny u PMF identifikací velmi prospěšné. Sekvenace za pomoci MALDI-TOF post-source decay (PSD) obvykle vytváří komplexní spektra a fragmentace není dokončena.
PSD sekvenace spolu s chemicky podporovanou fragmentací umožňuje se vyhnout těmto problémům. V následující části tohoto sdělení je prezentována aplikace obou metod při identifikaci bílkovin z Francisely tularensis.